1982年，经甘肃省人民政府批准建立了甘肃省省级自然保护区。
2006年，经国务院批准晋升为国家级自然保护区。
甘肃安南坝野骆驼国家级自然保护区位于阿尔金山北麓，阿克塞哈萨克族自治县境内，地处库姆塔格沙漠和阿尔金山之间，北接敦煌西湖国家级自然保护区，西邻新疆罗布泊野骆驼国家级自然保护区，南靠青海海西州，地理坐标为东经92°20′～93°19′,北纬39°02′～39°47′，总面积为396000公顷。
保护区海拔1480m～3870m之间。地貌以戈壁、荒漠、沙漠等为主。
气候属典型的温带干旱气候。干燥是这里气候的主要特征，年均蒸发量是降水量的60多倍，年均蒸发量接近或超过1630mm，水资源比较缺乏。
主要水系有安南坝保护区边缘海拔4500米的阿尔金山北麓的安南坝河，年径流量347万立方米，主要以阿尔金山的终年积雪和基岩裂隙储存水为主要水源。这也是保护区惟一可利用的水源。但是安南坝河在流经20余公里后，渗入戈壁滩。
2011年，发现了保护区同新疆交界处的“胡杨泉”泉眼。泉水水量极小，冬季结冰，夏季干旱断流。
安南坝野骆驼国家级自然保护区主要保护对象是野骆驼等野生动物及其栖息环境。
截止2009年，保护区内共有高等植物24科68属116种，其中裸子植物1科1属3种；被子植物23科67属113种，而占绝对优势，缺乏蕨类和苔藓植物。在保护区中有甘肃植物新记录3种。有陆生野生动物120种，隶属于17目41科，其中 爬行类1目3科7种，鸟类11目24科71种，哺乳类5目14 科42 种。其中国家一级重点保护野生动物7种、二级21种；列入国家保护有益的或者有重要经济、科学研究价值的野生动物43种。陆生野生动物以鸟类占优势，占保护区陆生野生动物种类的59.2%；哺乳类次之，占35%；爬行类占5.8%。
保护区动物主要有野双峰驼、蒙古野驴、雪豹、盘羊、岩羊、鹅喉羚等多种珍稀动物，尤其野双峰驼为主。
甘肃安南坝野骆驼国家级自然保护区管理机构是甘肃安南坝野骆驼国家级自然保护区管理局。
甘肃安南坝野骆驼国家级自然保护区管理局职责：
1.负责贯彻执行国家和省上有关自然保护区建设的法律法规和方针、政策，制定各项管理制度，并组织实施；
2.负责调查保护区各类自然资源并建立档案，组织环境与资源监测，保护生态和自然资源；
3.组织和协助有关部门开展科学研究和推广应用；
4.从有利于保护区工作出发，进行适度合理的产业开发工作。
野骆驼是世界自然保护联盟列入红皮书的一级濒危物种，中国将其列为一级保护动物，全世界的野骆驼总数在730-880峰之间（2014年），成为比大熊猫还要稀少的珍稀物种。截止至2014年，中国成立了3个野骆驼保护区，即新疆罗布泊野骆驼国家级自然保护区、甘肃省阿克塞县安南坝野骆驼国家级自然保护区和中蒙边境的保护区。据中国林科院森林生态环境与保护研究所2011年底进行的调查显示，阿尔金山北麓及库姆塔格沙漠南沿是中国野骆驼的主要分布区，而安南坝保护区又是野骆驼生存和繁殖比较集中的地区，被称为中国野骆驼的“产房”。
据国际野骆驼权威专家考察，2014年，中蒙边境地区约有野骆驼100峰，新疆罗布泊野骆驼国家级自然保护区核心区最多有120多峰，阿克塞县安南坝野骆驼自然保护区已成为中国野骆驼的主要生存地，该区域的野骆驼数量达300-400峰，数量占全世界野骆驼总数的一半。2013年底，专家通过红外线照相机监测、实地观察监测，发现该地区的野骆驼幼驼数量增多，野骆驼数量稳中有升。
