历史沿革
1939年前属长汀县飞地贴长乡，梅花山自然保护区地理位置得天独厚，野生动植物资源极为丰富。
为了保护梅花山珍贵森林生态系统和奇特的自然景观。
1985年5月，福建省人民政府批准建立闽西梅花山自然保护区。
1988年9月经国务院批准，梅花山自然保护区升列为国家级森林和野生动物类型自然保护区。
1992年2月，在原林业部和世界自然基金会联合召开的“中国自然保护优先领域研讨会”上，保护区以“现存华南虎数量最多、活动最频繁的区域”被确定为“对全球有影响、具有国际意义的”世界A级自然保护区。
1992年11月，在中国生物多样性保护行动计划第二次研讨会上，保护区以“物种丰富、特有种多，在东亚植物区系中为华中、华南、华东区系交汇处”，列入《中华人民共和国生物多样性保护行动计划》“中国优先保护生态系统名录”和“森林生态系统的优先保护区”；1993年加入中国人与生物圈保护区网络。
1998年，根据国家林业局的《关于进一步加强国家级自然保护区管理的通知》精神，龙岩市委机构编制委员会批准，福建梅花山国家级自然保护区管理处更名为“福建梅花山国家级自然保护区管理局”。
地理环境
位置境域
梅花山国家级自然保护区保护区地处福建西南部，是武夷山脉南段东南坡与戴云山脉之间的玳瑁山主体，为新罗、连城、上杭三县（区）的交界地带，俗称“梅花十八洞”，介于东经116°45′25″~116°57′33″，北纬25°15′14″~25°35′44″之间。保护区东西宽20公里，南北长19公里，总面积22168.5公顷。
地貌
保护区是闽西玳瑁山的主体部分，地貌以中山为主，地势中部高，四周低，西部高，东部底，平均海拔900米，千米以上山峰达70多座，最高石门山海拔1811米，相对高差达1436米，在大地构造上，属永梅坳陷带的一部分，历经多次构造运动，燕山运动导致大规模的花岗岩侵入，断裂构造的发育，使地形切割破碎。
气候
保护区地处中亚热带南缘，离海洋较近，常受到东南海洋暖湿气流影响，加上西北武夷山脉和东南戴云山脉作天然屏障，对寒流南下和海洋暖湿气流入侵起阻挡和截留作用，形成冬暖夏凉，气温、湿度较为稳定的特点。保护区年均气温13～18℃，最高月均温22.9～23.8℃，最低月均温7.5～8.3℃，极端最高气温35℃，极端最低气温-5.5℃，月均温≥10℃的年活动积温4500～5100℃，年日照时数1920小时左右。梅花山是福建省暴雨中心地之一，降雨期长，雨量充沛，降雨强度大，年均降雨量为1700～2200mm，相对湿度70～96%，霜期75天，霜日15～25天。
水文
在山岭之间发育有断裂谷地和断陷盆地，是九龙江、汀江、闽江的上游水系组成部分，为闽江、汀江、九龙江的分水岭，俗称"水流三江地"。由于复杂的地质构造和流水切割的影响，加之茂密的森林覆盖，构成闽西独特的天然空调和生物水库。
功能区划
保护区按功能区划为核心区、缓冲区和实验区。总面积为22168.5公顷，其中核心区面积7041.7 公顷，缓冲区2443.1 公顷实验区划2683.7 公顷。
生物资源
植物
梅花山保护区植物区系成份复杂，植被区系具有中亚热带南缘向南亚热带过渡的特点，组成典型的亚热带森林植被，有亚热带常绿阔叶林，针叶林，针、阔、竹混交林，竹林，亚热带山地灌丛，草丛等11个植被类型63个植物群系。区内植物种类仅维管束植物有184种734属1628种，其中属国家重点保护区的有观光木、福建柏、钟萼木、伞花木等23种，珍稀植物60余种。
动物
梅花山自然保护区属东洋界的中印亚界偏中北地带，具有向古北界的中亚过渡性，蕴藏栖息着丰富的野生动物。有陆栖野生动物362种，兽类6日20科66种，鸟类17目40科198种，爬行类3目10科40属69种，两栖类2目8科29种，还有鱼类5目14科51属65种，贝类4目15科27种及浮游动物9目32科170种，有昆虫20目150余科2000余种，大型真菌116种。
保护对象
植物
维管束植物有184科734属1628种（含变种和亚种）（名录见梅花山自然保护维管束植物名录和附件四植被补充调查报告）。其中蕨类植物30科62属107种，裸子植物7科18属22种，被子植物147科654种属1499种。单种属有11属，占总属数的1.5%；每属含1种，但并非单种属有454属，占61.8%；含2—4种的有245属，占33.4%；含5—6种的有26属，占3.5%；含10种以上的有38属，占5.2%。含属种较多的科有：壳斗科6属43种，樟科9属48种，木兰科10属24种，金缕梅科8属19种，蔷薇科16属79种，豆科42属94种，大戟科15属31种，冬青科1属31种，山茶科9属30种，杜鹃科7属32种紫金牛科5属18种，山矾科1属20种，马鞭草科4属16种，桑科9属20种，荨麻科9属25种，蓼科3属26种，野牡丹科8属14种，唇形科15属22种，茜草科23属41种，忍冬科3属18种菊科31属54种禾木科62属135种，莎草科14属53种。壳斗科、樟科、木兰科、山茶科、蔷薇科、杜鹃科、山矾科、冬青科等组成本区常绿阔叶林或针阔叶混交林的主要种类，而且大多是阔叶林的建群种、优势种或亚优势种。
动物
国家重点保护的有华南虎，金钱豹、云豹、金猫、黑鹿、梅花鹿等42种珍稀动物和金斑啄凤蝶，詹彩臂金龟等珍稀昆虫。属国家一级保护的种类有七种，二级保护的种类有三十种，其中群数量较多的有猕猴，穿山甲、白鹇、虎纹蛙四种。
旅游资源
保护区独特的地理环境，奇特地貌特征，丰富的森林资源造就了丰富的自然景观。既有类型多样、色彩丰富、四季变化的森林景观资源，也有活泼可爱、形态憨厚或凶猛无比的动物景观，更有奇山、异石，美丽的山花，秀丽的水体和奇幻的天象景观。
山地景观
水流三江地：保护区内连城县曲溪乡位于海拔1100米的黄胜地，其源流分别注入经福州、漳州和广东潮州入海的福建三大水系，即九龙江、汀江、闽江，因而自古就称为“水流三江地”。
王母点兵：梅花山狗子脑北面，有一方圆十几平方公里的中山草甸地，中央突兀拔起一座高山，是传说中的"王母点兵台"，四周环绕着千米左右几百个连绵起伏的山包，则是驻守山寨的军营。
产“蛋”的山谷：位于大斜村的一座山谷，四周竹木葱茏，谷地中有一长数十米经常年雨水侵蚀形成的布满苔藓的黑褐色卵形巨石带。
此外区内还有奇峰耸峙、怪石嶙峋的庙金山；栩栩如生、呼之欲出的棋盘石、羊角石；神话连篇、充满传奇的金钱吊葫芦、出米石、翠鸟登潭等。
水域景观
由于断裂构造、小断裂、节理裂隙发育，加上降水量大，地形坡度陡，，河床切割深等原因，形成梅花山独特的景观资源。有奇特的清水溪、汶水溪和七口龙潭；壮观的鲤鱼寨瀑布、兴隆瀑布；池水清澈、碧水连天，风光秀丽的梅花山天池；有如神功天造的双车温泉群。
生物景观
梅花山气候宜人，四季长青。由于独特地质地貌，植被、气候等条件因素，形成多层次、多类型的自然旅游资源。区内有天然大径级杉木林王国，古木参天；有中亚热带灌木林景观；有南方红豆杉林；此外还有杜鹃花山、山樱花路。
人文景观
梅花山自然保护区在当地政府的支持下，于1998年率先于全国启动华南虎拯救工程。现已初具规模，该工程项目占地466公顷，区内设有华南虎野化繁育区、草食动物区、森林浴场、水上珍禽区、蛇园等，一方面作为华南虎繁育研究及野化豢养的场所，另一方面作为保护区的一个主要的生态教育基地。此外周边还有丰富的可借人文景观，如古田会议址，永定土楼，龙岩天宫山，崐连城中华性海寺，虎豹别墅，李氏大宗祠等。
保护价值
梅花山由于山体高大及所处的特定地理位置，形成了典型的亚热带湿润山地气候，因离海洋较近，常受到东南海洋暖湿气流的影响，加上西北和东南有武夷山脉和博平岭作天然屏障，对寒流南下和海洋暖湿气候入侵起阻挡和截留作用，形成龙岩中心城市冬暖夏凉，气温、湿度较为稳定的特点。梅花山的存在不仅对龙岩中心城市气候调节起着不可代替的作用，而且对邻近地区的气候产生巨大影响，由于山体对冷空气的屏障作用，使处于梅花山东南侧的雁石溪谷地、永定河谷地及南侧的黄潭河谷地、汀江谷地成为整个闽西地区热量最丰富的地方。
管理现状
根据保护区主要保护对象的要求和管理目标需要，建立了较为完善的管理体系。保护区管理局下设办公室、林政科、科技科、经营科、财务科、防火办等6个管理科室以及森林公安分局和华南虎繁育研究所。按管理局—保护管理站、森林公安分局—森林派出所模式设置两级管理，有4个保护管理站， 3个派出所，另外还有7个护林哨卡、1个瞭望塔。 先后制定了《梅花山自然保护区管理办法（试行）》、《福建梅花山国家级自然保护区管理局岗位职责管理制度》、《福建梅花山国家级自然保护区管理局森林防火联防群治管理预案》、《福建梅花山国家级自然保护区管理局生态公益林管理实施方案》以及有关财务资产管理、来宾接待、干部职工请假、考勤等的规章制度。
森林覆盖率从建区前的60.4%上升到目前的94%，并多次被省、市授予“无森林火灾”单位。1999年12月，被国家环保总局、国家林业局、农业部、国土资源部等部门联合授予“全国自然保护区管理先进集体”，被国家林业局授予“2002-2003年度自然保护区管理先进单位”等荣誉称号。
通过实施保护区一期工程项目建设，保护区基础设施建设初具规模，现有管理局、公安分局、华南虎繁育研究所、两个保护管理站和一个护林哨卡等的办公用房及相应的办公用具、车辆、通讯设施和设备等。同时，在区界周围立碑定界，设宣传牌143个；先后新建和维修林道、人行便道38km。2004年底国家林业局批复了“福建梅花山国家级自然保护区管理局二期工程建设”项目。
