该公园建设定位是以东江湿地生态系统为核心，以河流自然景观和苏家围客家风文景观为特色，以丰富的湿地文化为内涵，集湿地保护保育、湿地功能和湿地文化展示、湿地休闲、东江画廊湿地景观、湿地可持续利用示范、湿地科研、监测和宣教于一体，兼备发电、灌溉和防洪调蓄功能的国家湿地公园。
东江国家湿地公园生态环境良好，动植物区系起源古老，珍稀动植物丰富，奇花异草散布湖湾、沙洲、岛屿，构成了生物资源宝库和旅游资源基调。东江河岸由光荚含羞草(俗称：簕仔树)和粉单竹为优势种的完整连续的河岸林，在国内的河流中已很难见到完整连续的河岸林。粉单竹竹影摇曳，簕仔树树型优美，构成了东江两岸景观秀美的绿色屏障，也是野生生物迁移的生态走廊。
东江江心分布着大小形状各异的数十个沙洲，形成壮观的沙洲群，碧草茵茵，形成独特的沙洲岛屿沙洲湿地植被景观。置身其中，莺飞鸟鸣，令人心旷神怡，流连忘返。在这里可以坐观江中水禽随波荡漾，欣赏牛与鹭鸟碧野田间相依相傍，构成一幅如诗如画的山水画卷，人与自然、人与动物和谐相处的天然佳景。沙洲上及其边缘的沙滩是鼋等珍稀保护水生野生动物的良好栖息生境。调查表明，东江湿地公园内有高等维管植物356种，水生植物丰富，形成了多种多样的湿地植被类型，包括挺水植物群落、沉水植物群落、漂浮植物群落、湿生草甸群落等。东江湿地公园野生动物资源丰富，有鱼类68种，野生陆栖脊椎动物137种，其中两栖类10种，爬行类22种，鸟类85种，兽类20种;列入《国家重点保护野生植物名录》的植物2种，其中野生稻等国家II级保护植物2种。列为国家I级重点保护的野生动物有鼋、蟒蛇等2种，国家II级重点保护的野生动物有10种。还有数十株古树名木形成的古树群。
