遗址于1947年10月被发现，因“筑城以自卫”而得名。遗址城垣规模宏大，东西宽410米，南北长36米，城墙最高处20余米，遗址面积约14公顷。
1974年，北京大学历史系考古专业师生和省、樟树市文博工作者来到梦境一般的筑卫城，轻易的获得了两个不同时期的地层：上层为商周文化遗存，下层为新石器时代晚期的遗存。
在1974年、1977年两次考古发掘，揭露面积566平方米，文化堆积厚约3至4米，地层堆积解决了江西新石器时代演进商周的历史发展关系。
遗址出土的文物、遗迹众多，有斧、刀、铲等石器，鼎、罐、碗、纺轮等陶器，还有30余个房基柱洞的遗迹，这些充分说明樟树市境地在距今4500年前已经出现原始村落，先民们过着以农业为主，渔猎经济为辅的定居生活，并已有制陶、纺织手工业父系氏族社会。
1977年，厦门大学历史系考古专业师生以及省、市的文博人员再次探访神秘古城遗址。
遗址城垣规模宏大，东西宽410米，南北长360米，周围土城墙最高的有21.8米，最低的也有10米左右，有6个城门可以进出（其中有一进一出二个水门）；遗址总面积147600平方米，遗址内有石斧、石铲、陶罐、陶壶等遗物和房基柱洞、方形地窖等遗迹。是江西发掘早的新石器时代遗址之一。经北京大学和省市专家两次发掘，上文化层相当于商周时期，属奴隶社会，下文化层相当于新石器时代晚期，属原始社会末期，处于父系氏族社会。
城内有一条内河与外河（古河道）相通，城外东北面是自然河流，南西面是人为的护城河；城内是较为平坦广阔的土地，内河的西南部有祭祀房屋遗迹现象及人工修整较平的大场地（可能是祭祀广场或宫殿遗迹），内河的东北部有3米多的文化堆积，是居住区；城的北面有内城，北城墙的外面有外城，东城墙的外面还有几座陶窑遗迹。整个筑卫城布局合理，功能齐配，防卫能力强，充分体现我们的祖先在远古时期聪明的才智、非凡的毅力，他们凭藉勤劳的双手开垦了这块肥沃的土地，同中华大地上的先民们一样，创造了樟树的历史文明，一个伟大的奇迹。出土的文物：石器有斧、刀、铲、凿、砺石等；陶器有陶鼎、豆、碗、壶、缸等。这些器物的出土标志筑卫城居民当时尚处"刀耕火种"的原始农业阶段，过着以农业为主，渔猎经济为辅的生活。
筑卫城遗址是全国重点文保单位，是以新石器时代晚期为主的遗址，也有青铜时代的遗存，距今已有5000多年。
该遗址的发掘与研究，使吴城遗址商文化的年代得以印证，是江南地区印纹陶遗址核心的著名遗址，为进一步了解江南地区文化全貌，确立江西乃至先秦考古学编年提供了科学的资料。现常有海内外游人和专家学者到此访古、考察。
樟树市政府于2011年底开始对筑卫城进行保护性的开发,省博物馆、樟树市旅游局、文化局、大桥街道办事处联合组建了考古队，对筑卫城遗址进行开发并恢复原貌。
