清咸丰十年四月（1860年6月），忠王李秀成率太平军攻克苏州。同年十月起，就吴姓拙政园基地改建忠王府，并将其东潘姓、其西汪姓宅第等一并收入，扩展为王府之地，形成一片包括官署、庭舍、园池“绵亘里许”的建筑群。
同治二年冬（1863年12月），苏州失守，忠王府修理工程仍未完工，但已初具规模，太平军退出苏州，李鸿章据忠王府为江苏巡抚行辕。
同治十一年（1872年），改为八旗奉直会馆。
民国二十七年（1938年），日伪据为"江苏省维新政府"驻所。
民国三十五年（1946年），国立社会教育学院借作校舍。
1951年，划归苏南区文物管理委员会。
1960年，改为苏州博物馆馆址。
忠王府位于苏州北寺塔路（原东北街），其主体即中路的官署，是按太平天国规制修建的，后虽经李鸿章拆去东西辕门、角楼、鼓吹亭，改大门为清代衙署样式，并涂改龙凤纹彩绘，但其他仍保持原貌。
中轴线上自南而北依次有照墙、大门、仪门、正殿、后堂、后殿等，纵深约140米。
忠王府大门面阔三间12.5米，进深10米，原为单檐歇山，后改硬山顶。前后檐柱上置阑额枋，架平板枋，施三参单昂斗拱，承檐桁，架抹角梁，置斗拱，托下金桁，承角梁。梁枋彩绘均被涂刷，龙凤痕迹依稀可辨，柱础均为青石覆盆式。次间脊柱之间砌隔墙，明间设断砌门，置抱鼓石。大门左右翼以八字墙，前踞石狮。抱鼓石和石狮均镂刻精细，气势不凡。仪门为硬山式，面阔三间13.5米，进深8.5米，梁、枋、桁间饰以彩绘。门后为石板广庭，东西廊庑各宽七间，隔庭相对。
正殿与后堂均硬山顶，各面阔三间，以纵深五架的卷棚顶穿廊过渡，连结为一整体，平面呈工字形，故俗称工字殿。正殿高约11米，面阔17米，进深14.5米。前置步廊，额枋上置平板枋，列一斗三升斗拱，上置连机承檐桁。廊柱头置丁字科前出挑承檐桁，后出梁垫承月梁。步柱间共设海棠花格心长窗十四扇，裙板浮雕云龙，绦环板饰以云凤纹。殿内梁架结构似厅堂抬头轩贴式，步柱与金柱间作船篷轩，金柱与后步柱架大梁，连后双步檐廊。明间后步柱间设屏门。后堂面阔14.2米，进深6.2米，后置步廊。梁架圆作，与正殿扁作相异。正殿与后堂的梁、枋、桁间均饰有彩绘。
后堂与后殿之间辟小院，有东西两厢相对。后殿硬山顶，高同正殿，面阔三间14.6米，进深10米。前设步廊，额枋上设平板枋，列一斗三升斗拱。廊柱有置单面出跳的丁字科。步柱与金柱间设船篷轩，金柱与后步柱间架大梁。后步柱之间设屏门十八扇，门枋与后步枋间设垫板，以引条分隔为九方，皆绘有壁画，内容以鹿、鹤、虎、豹、狮、象、鸳鸯、绶带鸟、白兔、花猫等鸟兽为主，配以树石花草，各有寓意。后檐柱与后步柱间相距仅1米，后檐高达7米，超出前廊桁2米，实属罕见。此殿原为太平天国供奉天父天兄神主，举行礼拜仪式的地方称为"圣殿"或"天厅"。
忠王府为署、宅、园为一体的建筑，其花园部分在王府的东部，现在属拙政园，目前的忠王府仍包含了汪硕甫宅园的部分建筑和庭院（汪宅的大部分在后来的清光绪三年（1877年），被吴县盐商张履谦以银价6500两购得，大加修葺，补残全缺，取名“补园”，现属拙政园），庭院中保留了明代文征明手植紫藤，枝萝漫卷，古朴苍劲。在忠王府正殿东侧戏厅内，还保留了一座大型的室内戏台，是清咸丰十年（1860年）李秀成攻克苏州后所建。忠王府原建戏台二、三座，太平天国失败后，其地屡经易主，诸多变迁，现仅存一座，戏台呈方形，二层建筑，通高8.78米。下层台面高出地坪0.98米，纵深8.7米，横宽6.17米。演出舞台面为42.6平方米，高4.4米，平顶，三面敞开，一面设置上下场门。上层高3.4米，外置低栏，内设活络窗板。台口有可以升降的铁杠一根，为演武戏“上杠子”时所用。80年代戏台仍在使用，1982年“苏、浙、沪两省一市昆剧会演"时，就在此戏台演出昆剧。
为忠王府东路建筑，堂外为紫藤院，后为戏厅。相传当年拙政园主王献臣与吴中才子文征明、唐寅、祝允明等相情相慕。仲春时节，藤飞花放，王献臣常在此宴饮诸子，名为“卧虬堂”。卧虬既因紫藤蟠屈似龙而名，又隐寓名士循世隐逸之意。
会馆是同乡人聚会之所，更是商贾贸易洽谈之地，往往建有戏台。古典戏台为忠王府东路建筑，是八旗奉直会馆利用南部四合院的庭院修建而成，虽经数次维修，基本保持其原貌，是目前国内保存完好的室内古典戏台之一。整个古典戏厅占地面积达450平方米，气势雄伟，高达9.85米，顶部为跨度达14.8米的歇顶式顶棚，在顶棚边檐下沿配翻窗47扇，补充室内的光线，造就了一个室内戏台。戏台长8.65米、宽6.10米、高0.96米，戏台正面墙壁为著名画家金心兰所作的梅花仕女图，雕刻在黄杨木圆洞门屏障之上，戏台东西两端各设上下台阶。台两旁及对面均为名家的书法壁画楠木画屏,共26扇52面，有沈周、唐寅、文征明、王宠、徐渭、王铎等名人书画，为工匠高手杨氏所镌，使整个古典戏台的文化氛围十分强烈，艺术价值甚高。1986年昆曲名家俞振飞先生在这里作了专场演出，深得中外人士的青睐，乔石、基辛格等一些国内外著名人士也曾在这里观摩、听书和看戏。
忠王府东路建筑，古典戏台后的第二进。因当时为满足旗人的居住习惯，将忠王府东路建筑改建为四合院，其风格完全是按照北京皇家四合院建造。其柱漆为朱红，而窗棂漆为墨绿，呈现一派富丽堂皇的景象，使我们后人在江南水乡也能领略北方四合院的建筑风格。总面积为720平方米。
鹤轩为忠王府西路建筑，鹤轩为三开间，其板壁均为楠木，故名楠木厅（又称花厅）。前有庭院,庭院和前大厅为一高墙所隔，原中有一圆洞门，高墙上有五扇形式各异的漏窗，庭院内有小石堆筑，雅致幽静，内有连理宝珠山茶两珠，为清初陈士遴时遗物，另一高大的洋玉兰树，有数百年树龄，并有一枝桂花，每年总是第一个开花，一般均开花2-3次。这些树均为一级保护古树名木。
走马楼为忠王府西路建筑，其为一围廊式两层建筑，原为太平天国时家眷住宅。上下楼不仅有楼梯，还有暗门。在楼东处有暗窗为圆洞式，可以了望，更可以越窗潜走。与鹤轩相对的是“幽生水室”，原室内柱上悬挂史可法的对联“斗酒纵横廿一史，炉香静对十三经”，绕廊行，室后又一室，为“鹤与琴书之室”,系洪钧先生手笔。在中央的天井内，原养有二只鹤于其中故名。其后折西即为张宅的住处，并行两幢为五开间带厢房的二层楼建筑，前幢还保留其原貌，特别是西北角的小姐闺房，很有特点。后幢于1976年拆除，梁柱均为黄杨木，其西北即为张履谦的花园，即“补园”。
忠王府东路大殿前有20扇长窗，海棠花格心，裙板浮雕云龙，中夹堂板（又称绦环板）缀以云凤，为太平天国时旧物。
忠王府的苏式彩绘亦堪称一绝。不仅数量多，而且艺术水平高，为全国所罕见。经调查统计，原有包袱棉285方，如意头210个，共有彩绘495方，其中3/4为山水、花鸟、走兽及绚丽的锦纹，取材大多寓意福禄寿、吉庆有余、百事如意、锦上添花等，如钱蝠（全福）、柏鹿（百禄）、蝠磐（福庆）、蜂猴（封侯）等。其中反映太平天国艺术特征的主要是龙凤艺术，如大门、仪门的额枋和正殿的额枋、步桁、脊桁绘有“双龙戏珠”、“祥云团龙”、“丹凤朝阳”、“凤穿牡丹”，可惜早已被涂刷，仅有正殿东西次间脊桁上的两方“凤穿牡丹”幸存。如今，彩绘完整留存的共343方，其中323方是太平天国时期的原作，其余是后来涂改的。苏式彩绘以精雅秀丽著称，忠王府彩绘可谓现存清代苏式彩绘的代表作。
太平天国忠王府是全国保存至今完整的一组太平天国历史建筑物，第一批全国重点文物保护单位，是研究这段历史珍贵的文物资料。
