栖霞寺舍利塔为密檐式，五级八面。自下而上分为塔座、塔身和塔刹3部分，通高18米，全用白色石灰岩石砌造。塔座3层，自下而上为基座、须弥座和仰莲座。基座平面雕刻游于海水和祥云之中的龙、凤、鱼、鳖等纹饰，侧面雕石榴、凤凰图案。须弥座上下叠涩部分，侧面雕覆莲及石榴、狮子、凤凰纹饰，中间束腰部分作八面体，8个转角处均雕作半圆形角柱，柱上浮雕力士和立龙形象，柱间浮雕释伽牟尼“八相成道图”。
须弥座上置有三层莲瓣的仰莲座，以承塔身。塔身5层，每层均出檐深远，檐口呈曲线，上刻莲纹圆形瓦当和重唇滴水，背端饰龙头。第一层较高，约3米，撩檐石立雕飞天形象，八面转角雕作仿木倚柱，柱上设阑额，东西两面正中分别浮雕文殊、普贤像，南北两面雕石门，门柱镌刻经文，其余四面各雕一尊天王像。第二层高约1米，再上各层高度逐层减低。不设门，各层的8面都雕出两座圆拱状石龛，龛内浮雕一坐佛。塔刹5层，各有莲花雕饰。这种设台座的密檐式塔为现存石塔中早的实例。
该塔保存较好，仅部分檐、座石块坠落损坏。1930年由建筑家刘敦桢主持维修，重新设计制作塔刹（原刹已毁），并修补基座损毁部分。1950年代，据南唐样式复原基座石栏杆，并安装避雷设施；70年代，又增设铁栅护栏。
栖霞寺舍利塔改变了唐代的密檐塔只有一层低低的素平台基的做法，吸取了唐代某些小塔的造型方式，在塔下用须弥座为基座，座上并有仰莲式平座，开创了以后密檐塔逐渐华丽的先风。栖霞寺舍利塔体量不大，各檐都由整块石材刻成，挑檐较深，檐下只刻出凸圆线脚，不雕斗拱，柱枋雕刻也简单有节，整体权衡包括敦实的塔刹都很得体，虽大体仍模仿木结构建筑的造型，但并未失掉石材的本性和小塔应具的一种婀娜风度，艺术价值很高。栖霞寺塔石面布满了浮雕，是五代雕刻精品。
