文庙位于菏泽市巨野县城东南隅，永丰塔北约一百米处。文庙前后五进院落及东西跨院，共建有殿、堂、楼阁、斋、庑、亭、坊近百间。自南而北，以太和元气坊、棂星门、泮池、戟门、大成殿,、明伦堂、尊经阁等形成文庙，中轴线两侧建有进德斋、修业斋、东庑、西庑、名宦祠、乡贤祠、忠义祠、东华门、西华门等，东跨院为文昌祠，是儒学所在地；西跨院为启圣祠，后改作训导宅。大成殿内，祀有孔子，四配颜回、曾参、子思、孟轲，十二哲闵损、冉雍、端木赐、仲由、卜商、有若、冉耕、宰予、冉求、言偃、颛孙师，朱熹的塑像两侧列“七十二贤”牌位。整个建筑布局得当，错落有致，间以苍松翠柏，形成一处气势磅礴、郁罩葱茏的古建筑群。
宋金时期，巨野文庙原建于城北，屡经河患，废立不一。1382年（明洪武十五年）县丞吕让移建于今址。历代曾多次增修扩建，至1702年（清康熙四十一年），县令章弘鼎新正殿，续成诸祠，规制乃备，占地30余亩。
1753年（朝隆十八年）。巨野县知县朱容极在此建麟州书院，此后经道光、光绪以及民国年间多次建修葺，书院更具规模，志名远播。
1947年，文庙被废，大部分建筑被毁，仅存大成殿，殿内塑像亦遭劫难。
新中国成立后，文庙旧址为粮食部门占用，大成殿一度曾为粮仓。党的十一届三中全会后，国家对文物保护尤为重视。1982年，山东省文物局拨专款对濒临倒塌的大成殿进行了修缮。1995年，粮所搬迁，复建了大成门，大成殿内恢复了孔子及四配塑像，制作神龛、御匾、香案等附属设施，殿前筑建了月台。后来，文庙逐步恢复了原有建筑，成为人们祭仰先哲，加强爱国主义教育的重要基地和展示巨野历史文明的窗口。
大成殿是文庙的主体建筑，殿基为砖，石混砌，台基高1.4米，东西长22.3米，南北宽14.25米，大殿通高13.7米，面阔5间，进深3间，重檐九脊歇山式建筑。翼角飞翘，绿瓦朱甍，斗拱盘错，雕梁画栋。殿四周有24根大型石柱支擎，石柱高3.48米，径约0.55米。前檐下8根石柱以及后檐端柱为高浮雕二龙戏珠，上缀浮云，下着波涛，造型生动，雕琢精工。其它石柱为浅浮雕缠枝花卉，构图繁缛，技艺精湛。后廊中间两根石柱上分别刻有“大清康熙四十一年七月二十一日”、“宣议郎知巨野县事宛平章弘重建”铭文。殿内有朱红明柱八根，直径0.5米，下垫鼓形石础，上擎殿架，梁叠檩穿，勾心斗角，显示出高超的建筑艺术。此大成殿仿曲阜孔庙大成殿营建，是鲁西南现存较完整，具有较高艺术价值的古建筑。
