日本肌蛤暖水性种，广布于印度西太平洋区，如日本、朝鲜及东南亚等地，在国内主要分布在南部沿海，从东山以南至北部湾。
日本肌蛤贝壳稍小或中等大小，一般壳长36mm，高14mm，宽9mm。壳质薄、韧；壳较扁平，细长形。壳顶略凸，细圆；自壳顶至中腹缘有一条不很明显的隆肋。壳表呈黄绿色，有时略显浅红色；壳前端有少数放射纹，中部无，后背部有许多紫色和白色放射纹。贝壳内面色浅，略具光泽，并有壳表透过的红褐色花纹，肌痕不明显。铰合部窄，沿铰合线全长及其后方有一列小锯齿。韧带细长，浅褐色。外套缘厚，具圆球形触手，并具褐色素。水管稍呈管状；两闭壳肌不等。足丝软，胶状、较发达。
日本肌蛤仅见于潮下带，自水深10～100m以内的浅海底较普遍。底质多为泥沙、软泥、沙质泥或碎壳等。
