药草台寺，藏语称“卓仓大寺.扎西当噶”，坐落在乐都县曲坛镇药草台村。距县城西南30公里，距曲坛镇9公里。
明万历九年(1581年)，三世达赖喇嘛与蒙古王爷俺达汗在青海湖仰华寺相会后不久，到曲坛寺释法布经，他看到寺与村庄相邻，不利僧习法，建议另辟习法之所，寺院方面欣然接受，经过三十余年筹备，终于在明万历四十七年(1619年)建成习修法之地-----扎西当噶。从此，扎西当噶成为曲坛寺的习经学院，全寺僧人均在扎西当噶修习法典，而曲坛寺逐渐演变为卓仓部落政教合一的管理机构。
扎西当噶在其鼎盛年代，有僧侣500余名，到1958年前夕尚有100余人，寺内建有主体工程四柱大殿、弥勒殿、祈愿殿、吉洼殿、印经院等建筑，还建有佛塔五座，活佛囊钦府三院，僧舍百余户。法器法物应有尽有，一应俱全，铸有各种青铜和红铜佛像，唐卡，堆绣。有历代皇帝馈赐珍品，有各代达赖、班禅施舍之遗物。继三世达赖之后，五世达赖亦亲莅扎寺讲法，扎西当噶寺的寺规，就是由五世达赖亲手拟撰写的。五世和六世班禅还从西藏札什伦布寺寄来了馈赠品，由于历代达赖和班禅的扶持使扎西当噶佛光四射，成为安多地区格鲁派名刹之一。
958年，扎寺解体：法器、法物没收充公，少数亦流入民间，僧人全部还俗务农；1959年，青海省人民政府曾把曲坛寺、扎西当寺列为全省文物重点保护单位。1962年，寺院又短暂的开放，少数僧人重返寺院，香炉重新燃起，佛事活亦有起色。但是，“文革”倏起，扎西当噶寺被荡为废墟。
1985年2月(藏历第十六绕琼木牛年二月十五日)，乐都县人民政府批准扎西当噶寺重新开放。重建工作由八世夏尔·尕让噶居·洛桑晋美南嘉活佛亲自主持。1990年重建佛塔一室，三转五式经堂一座；1991年重修尕让活佛昂；1992年修弥勒佛殿，2000年三世活佛殿竣工；2001年修建了寺院大门。按规则举行了开光典礼，并邀请塔尔寺阿嘉、西纳等活佛前来参加隆重的开光典礼。恢复了正月十五“酥油花供灯会”和六月“毛兰姆祈愿大法会”。六月祈愿大会的主要内容为：初六念经祭鄂博，初七转香巴(即请弥勒佛绕寺院转郭拉)，初八晒佛，初九跳牛(即跳舞)。
