菏泽牡丹栽培已有近千年历史，在中国牡丹发展史上，长盛明、清两代，管领风骚500余年。它是在明清以来风格不一、大小不等的十几处牡丹园的基础上发展起来的，如清道光年间的赵氏园、桑篱园，创于明代的毛花园，以及当时的铁藜寨花园、大春家花园、军门花园等。牡丹园区内雕花彩绘，金碧辉煌，既敞朗宏伟，又古朴典雅。门坊正中的“凤凰戏牡丹”彩色图案下，悬挂着一块灿灿闪光的鎏金横匾，上书“曹州牡丹园”五个苍劲有力的大字，是著名书法家舒同所题。花园内有三个观赏区，若干观赏点，每区各成体系，形成园中园。“观花楼”、“天香阁”是园内主体建筑，新颖别致，古朴典雅，登楼眺望，园中景色尽收眼底。
湖山景区是全园的核心景区之一，在山水之间、林木之间不经意便会发现自然栽植的牡丹，或生于岩石之中，或洒于山坡之上，尽显牡丹自然之美。岩石园是湖山景区中的高潮部分，它是在原有山体的基础上规划的，采用台地叠石处理，牡丹与其他花灌木组景生长于石缝之中，层阶跌落的台地为各种花卉提供了良好的生长空间，与“迸珠溅玉”的叠瀑共同构建了层次丰富的立面景观效果。
四季展览温室建筑面积约2000平方米，建筑外形像一个飘逸的飘带，里面设计成多个小花园，展示从冷库中冷藏的品种催花牡丹，供游客四季观赏。
牡丹的主体观赏区有九大色系圃、十大花型圃，牡丹品种1237个，牡丹总量达到80万株。
天香阁是一座祭花神的仿古式建筑，是公园的制高点，登临其上，可以总览全园。内有卧佛殿，殿内供奉的玉卧佛是山东省最大的玉佛，长5.4米，重25吨，系整块缅甸玉雕琢而成，由傅作义将军之女傅凤英女士无偿捐赠。
市区乘坐3路公交车，在牡丹园下车即是。
日东高速—菏泽出口处下高速—沿220国道西行20米左转—沿人民路向南行100米—曹州牡丹园东大门
曹州牡丹园是菏泽最大的牡丹、芍药培育和输出中心。拥有牡丹、芍药、绿化苗木大田花卉生产基地近4000亩，其中牡丹标准化生产示范基地450亩，牡丹品种1237余个，芍药品种600余个。从北京中南海到全国各大中城市，都植有该园的牡丹、芍药，并远销美国、日本、韩国、英国、法国、荷兰、南非等国，为日本承建的大型“中国牡丹园”。
曹州牡丹园是菏泽牡丹民间科研中心，科研成果近百项，分别获国家、部委和省、市奖。1994年代表国家参加法国波尔多国际花卉博览会，获得大奖。在“1999年昆明世界园艺博览会”上，获牡丹单项奖81项，占世界牡丹总奖项的73%。在2002年全国牡丹催花大赛中，获得奖项114个，高居榜首。牡丹园被中国花协评为“全国花卉先进企业”，被国家标准化委员会指定为“国家级牡丹芍药标准化示范园区”，并作为国家高技术研究发展计划（863计划）菏泽科研育种基地。
线路一：
曹州牡园东大门—牡丹广场—岩石园—国花门—观花楼—牡丹主观赏方—国花馆—西大门
线路二：
曹州牡丹园东北大门—世界国花园—天香阁—芍药台—牡丹传奇—岩石园—十二花神—主观赏方—西大门
