《针灸甲乙经》，又称《黄帝甲乙经》《黄帝三部针经》《黄帝针灸甲乙经》。西晋·皇甫谧撰，12卷，128篇，成书于公元282年。前六卷论述基础理论，后六卷记录各种疾病的临床治疗，包括病因、病机、症状、诊断、取穴、治法和预后等。采用分部和按经分类法，厘定了腧穴，详述了各部穴位的适应证和禁忌、针刺深度与灸的壮数，是我国现存最早的一部理论联系实际的针灸学专著。
《针灸甲乙经》卷一至卷六为中医基本理论和针灸基础知识，卷七至卷十二为临床治疗部分，包括各种疾病的病因病机、症状和腧穴主治。卷一主要论述人的生理功能以及脏腑与肢体五官的关系等。卷二论述十二经脉、奇经八脉、十二经标本、经脉的循行路线和发病情况以及骨度、肠度等。卷三为腧穴主治部分，共厘定了腧穴348个（其中单穴49个，双穴299个），并采用分部依线的方法，划分了头面、颈、胸、腹、四肢等35条线路。详细叙述了各穴的部位、针刺深度与灸的壮数。卷四叙述了诊法，包括望闻问切四诊的具体内容，重点论述了四时平脉与脏腑病脉、死脉以及三部九候的诊断方法。卷五为针道，详述了九针的形状、长度和作用、针刺的手法和补泻的方法、针刺的禁穴与禁忌等。卷六以阴阳五行学说为核心，论述了生理与病理方面的一些具体问题。从卷七至卷十二为临床治疗部分，包括内、外、妇、儿等科，尤以内科为重点，涉及多种病证，在治疗方面，书中介绍了晋以前针灸治疗各种疾病丰富而宝贵的经验，全书共列腧穴主治800多条，为后世针灸治疗学的发展打下了良好的基础。同时《针灸甲乙经》的腧穴和腧穴主治部分保存了已失传的《明堂孔穴针灸治要》的内容。
皇甫谧总结了魏晋以前的针灸学成就，吸收了《素问》《针经》《明堂孔穴针灸治要》的精华，删其浮辞，除其重复，做了十分繁重的选材整理工作，并加入了自己的实践经验而著成本书。
皇甫谧（215～282），魏晋间学者、作家、医学家。幼名静，字士安，号玄晏先生，安定朝那人。从席坦学儒。武帝屡下诏征，皆称病不就，终身不仕。左思作《三都赋》成，请其作序，遂见重于世。中年患风痹，乃钻研医学。著有《帝王世纪》、《高士传》、《烈女传》、《玄晏春秋》、《针灸甲乙经》等。
臣闻通天地人曰儒，通天地不通人曰技，斯医者虽曰方技，其实儒者之事乎。班固序《艺文志》，称儒者助人君，顺阴阳，明教化，此亦通天地人之理也。又云∶方技者，论病以及国，原诊以知政。非能通三才之奥，安能及国之政哉。晋·皇甫谧博综典籍百家之言，沉静寡欲，有高尚之志。得风痹，因而学医，习览经方，前臻至妙。取黄帝《素问》、《针经》、《明堂》三部之书，撰为《针灸经》十二卷，历古儒者之不能及也。或曰：《素问》、《针经》、《明堂》三部之书，非黄帝书，似出于战国。曰：人生天地之间，八尺之躯，脏之坚脆，腑之大小，谷之多少，脉之长短，血之清浊，十二经之血气大数，皮肤包络其外，可剖而视之乎？非大圣上智，孰能知之，战国之人何与焉。大哉！《黄帝内经》十八卷，《针经》三卷，最出远古。皇甫士安能撰而集之，惜简编脱落已多，是使文字错乱，义理颠倒，世失其传，学之者鲜矣。唐·甄权但修《明堂图》，孙思邈从而和之，其余篇第亦不能尽言之。国家诏儒臣校正医书，今取《素问》、《九墟》、《灵枢》、《太素经》、《千金方》及《翼》、《外台秘要》诸家善书校对玉成，缮写将备亲览。恭惟主上圣哲衣冠文明，光辉上下，孝慈仁德，蒙被众庶，大颁岐黄，远及方外，使皇化兆于无穷，和气浃而充塞，兹亦助人灵，顺阴阳，明教化化之一端云。
国子博士臣高保衡尚书屯田郎中臣孙奇光禄卿直秘阁臣林亿等上
夫医道所兴，其来久矣。上古神农始尝草木而知百药。黄帝咨访岐伯、伯高、少俞之徒，内考五脏六腑，外综经络血气色候，参之天地，验之人物，本性命，穷神极变，而针道生焉。其论至妙，雷公受业传之于后。伊尹以亚圣之才，撰用《神农本草》以为汤液。中古名医有俞跗、医缓、扁鹊，秦有医和，汉有仓公。其论皆经理识本，非徒诊病而已。汉有华佗、张仲景。其它奇方异治，施世者多，亦不能尽记其本末。若知直祭酒刘季琰病发于畏恶，治之而瘥，云：后九年季琰病应发，发当有感，仍本于畏恶，病动必死，终如其言。仲景见侍中王仲宣时年二十余，谓曰:“君有病，四十当眉落，眉落半年而死，令服五石汤可免。”仲宣嫌其言忤，受汤而勿服。居三日，见仲宣谓曰：“服汤否？”仲宣曰：“已服。”仲景曰:“色候固非服汤之诊，君何轻命也。”仲宣犹不言。后二十年果眉落，后一百八十七日而死，终如其言。此二事虽扁鹊、仓公无以加也。华佗性恶矜技，终以戮死。仲景论广伊尹汤液为数十卷，用之多验。近代太医令王叔和撰次仲景，选论甚精，指事可施用。按∶《七略·艺文志》，《黄帝内经》十八卷。今有《针经》九卷，《素问》九卷，二九十八卷，即《内经》也。亦有所亡失，其论遐远，然称述多而切事少，有不编次。比按仓公传，其学皆出于《素问》，论病精微。《九卷》是原本经脉，其义深奥，不易觉也。又有《明堂孔穴针灸治要》，皆黄帝岐伯选事也。三部同归，文多重复，错互非一。甘露中，吾病风加苦聋，百日方治，要皆浅近，乃撰集三部，使事类相从，删其浮辞，除其重复，论其精要，至为十二卷。《易》曰：观其所聚，而天地之情事见矣。况物理乎？事类相从，聚之义也。夫受先人之体，有八尺之躯，而不知医事，此所谓游魂耳。若不精通于医道，虽有忠孝之心，仁慈之性，君父危困，赤子涂地，无以济之，此固圣贤所以精思极论尽其理也。由此言之，焉可忽乎？其本论其文有理，虽不切于近事，不甚删也。若必精要，后其闲暇，当撰核以为教经云尔。
有北宋熙宁二年初刊本、南宋及元刊本、明正统二年（1437）重刊本、嘉靖刊本及《医统正脉》刊本等。
北宋熙宁二年（1069），林亿等曾对《针灸甲乙经》作校对缮写，即所称“新校正”。1980年山东中医学院主持编写了《针灸甲乙经》校释，人民卫生出版社出版。
《针灸甲乙经》对针灸的发展起了承前启后的巨大作用，由晋到宋的针灸著作，如《铜人腧穴针灸图经》，其穴位和适应证基本上没有超出本书的范围。如《针灸资生经》等专著，无不遵循本书编辑而成。明清两代的针灸著作，如《针灸聚英》《针灸大成》等都是在本书基础上发展起来。《针灸甲乙经》还流传至日本、朝鲜，对两国的针灸学术与教育产生深远影响。
