西藏自治区第三人民医院是国家“十一五”期间最大的医疗卫生项目之一，是西藏自治区唯一一所传染病专科医院。
2020年3月，西藏自治区第三人民医院获得西藏自治区三八红旗集体荣誉称号。
2020年3月，西藏自治区第三人民医院获得西藏自治区三八红旗集体荣誉称号。
2020年11月20日，获评第六届全国文明单位。
2021年4月19日，西藏自治区第三人民医院发热门诊、预检分诊被中华全国总工会授予“全国五一巾帼标兵岗”荣誉称号。
2021年10月，被表彰为第六届全国杰出专业技术人才先进集体。
2021年12月15日，全国科技系统抗击新冠肺炎疫情表彰工作领导小组办公室发布公告，西藏自治区第三人民医院列入全国科技系统抗击新冠肺炎疫情先进集体拟表彰名单。
目前开放科室十余个，编制床位200张，开放床位196张。临床科室6个，医院内设管理科室10个（党委办公室、医院办公室、政工人事科、财务科、医务科、护理部、感控科、总务科、信息科、医保办），专业技术科室10个（肺一科、肺二科、肝病科、感染科、急诊科、外科、影像科、药剂科、检验科、供应室）。
