幼年时，父母被仇家杀害，自己因躲在邻村得以幸免。
1574年（万历二年），年仅十三岁手刃仇人，后前往嘉木瑚寨（今辽宁抚顺境内）投奔姑父穆通阿，并与表兄哈思护相处甚欢。
1580年（万历八年），不顾姑姑的反对，随努尔哈赤离去。
1583年（万历十一年），努尔哈赤起兵讨伐尼堪外兰，额亦都随军夺取图伦城、色克济城、舒勒克布占城。额亦都骁勇善战，能开十石强弓，经常以少胜多，努尔哈赤对他日见亲信。
1587年（万历十五年），额亦都率军攻打巴尔达城。战后，努尔哈赤授他巴图鲁称号。不久，在对萨克察的战役中，率军连下克尼玛兰城、章家城、索尔瑚寨。
1593年（万历二十一年），叶赫、乌拉、哈达等九部联军进犯建州，攻打黑济格城。努尔哈赤亲自在古勒山陈兵抵御，并命额亦都率百骑挑战。额亦都力斩九人，击退敌军，生擒叶赫贝勒布寨，趁胜夺取诺赛寨、兆佳村。不久，与噶盖、安费扬古攻破佛多和山，斩杀搜稳塞克什。
1599年（万历二十七年），随努尔哈赤平定哈达部。
1607年（万历三十五年），随贝勒巴雅喇征讨东海女真渥集部，夺取席黑、俄漠和苏鲁、佛讷赫拖克索等三路，不久又随军灭亡辉发部。
1610年（万历三十八年），奉命安抚渥集部的那木都鲁、绥分、宁古塔、尼玛察四路，招降康古礼等十九人，不久又趁胜夺取雅揽路。
1611年（万历三十九年），与何和礼、扈尔汉征伐渥集部虎尔哈路，攻克札库塔城。
1613年（万历四十一年），随平乌达部。
1615年（万历四十三年），努尔哈赤创建八旗，额亦都隶属于镶黄旗。
1616年（后金天命元年），努尔哈赤自称汗王，建立后金，任命额亦都、费英东、何和礼、扈尔汉、安费扬古为五大臣，同听国政。
1617年（天命二年），与安费扬古攻打明朝，夺取马根单、花豹冲、三岔儿等堡垒。
1619年（天命四年），明朝辽东经略杨镐分兵进犯后金，代善等四大贝勒率军抵御，兵至太兰冈。后随努尔哈赤大败明军杜松部。不久，额亦都作为前锋，先后在尚间崖、阿布达里冈击败明军马林部、刘綎部。
额亦都屡随努尔哈赤征战，未尝败绩，每次受到封赏，都分给有功将士，从不独占。努尔哈赤对他非常优厚，先后将自己的族妹、女儿嫁给他。
后来，努尔哈赤封额亦都为左翼总兵官、一等大臣，还将他的部属分为三个世管牛录，安置在镶黄旗、正白旗之下。
1621年（天命六年），额亦都在沈阳病逝，终年六十。
1627年（天聪元年），清太宗追封额亦都为弘毅公。
1636年（崇德元年）天聪十年四月十一日，皇太极率诸贝勒大臣斋戒三日，以十一日乙酉，建国号曰：大清，改元崇德，肇建太庙于盛京，大祀天地礼。
1636年（崇德元年）天聪十年四月十二日，皇太极将额亦都和费英东两人的灵位安放在清太祖神位之左右，享配太庙，深受当时的王公大臣尊崇和礼遇。
1654年（顺治十一年），顺治帝命人为额亦都立碑，并亲自撰写碑文，表彰额亦都的功劳。
顺治帝：忠勇忘身，有始有卒，开拓疆土，厥积懋焉。
道光帝：弱冠从龙早，雄才翊运生。联绳麾众士，断矢拔坚城。所向原无敌，先登莫与争。天题旌勇敢，钟鼎勒勋名。
赵尔巽：国初置五大臣以理政听讼，有征伐则帅师以出，盖实兼将帅之重焉。额亦都归太祖最早，巍然元从，战阀亦最多。费英东尤以忠谠著，历朝褒许，称佐命第一。何和礼、安费扬古、扈尔汉后先奔走，共成筚路蓝缕之烈，积三十年，辅成大业，功施烂然。太祖建号后，诸子皆长且才，故五大臣没而四大贝勒执政。他塔喇希福祖罗屯，传言列五大臣，或初阙员时尝简补欤？草昧传闻，盖不可深考矣。
《钦定八旗通志/卷首之五》（钮祜禄氏）为我满洲大族，而额亦都巴图鲁乃太祖、太宗朝开国元勋。
《皇清开国方略/卷七》…左翼总兵官额亦都卒。额亦都每遇攻城略地奋勇争先多立功绩，初赐号巴图鲁，后擢为一等大臣，与费英东等并辅国政。至是卒。太祖亲临其墓，恸哭者三乃还。
《钦定盛京通志/卷七十五》安费扬古性贞亮有勇略，与额亦都等俱为开国功臣之首。《卷六十八》岁癸丑从征乌拉㧞其城，费英东…寻命与何和礼、额亦都、扈尔汉、安费扬古为五大臣，佐理国事。
