百花山是国家2A级旅游景点。百花山一山连两区，山北为门头沟区，由百花山自然保护区管理和黄安坨村所辖，位于北京门头沟西部黄塔乡黄安陀村南，百花山距京城120公里。为常规的百花山旅游线路；山顶及阳坡面归房山区史家营乡所属，距北京市区110公里，山下的莲花庵村大力发展民俗旅游，已修成了直达山顶的公路。
主峰百花山海拔1991米，白草畔海拔2050米，为北京市第三高峰。百花山的风景资源可分为四大景区，35个景点：百花山主峰景区、百花山草甸景区、望海楼景区、百草畔景区;有“百花草甸”、“百草山瀑布”、“万年冰肌”、“古树擎天”、“云顶日出”、“古石海”、“云海升腾”、“晚霞映翠”、“蚂蚁山”、“送树长廊”等著名景观。这里风景独特、气候宜人，群山环抱、奇峰连绵、溪水潺潺云遮雾障、劲松森林，奇花异草，稀禽珍兽。这里群山环抱，气候宜人，奇峰连绵，溪水潺潺，云遮雾障，劲松森林，奇花异草，稀禽珍兽。此处群峰挺拔，四季如春，繁花似锦，其中百花峰冠出群峰，惠来古八景谓之“百花领袖”，上有百花园及古百花岩遗址，传说唐高僧大颠曾在此修行。南侧山腰有庄严禅寺，建于清乾隆年间，近年修葺一新，寺周有百花灵泉、玉石水门、飞炉显圣、动摇石、试剑石等景点。流传民间的百花公主的动人传说，更为此山蒙上一层神奇色彩。
百花山集山势峭拔和瀑布激流于一体。登高峰可以观赏云海、日出以及群峰险峻；入峡谷可以观赏大瀑布--百花山瀑布落差150米，水幅宽15米，飞奔而下，气势非凡，声动山林。百花山动、植物资源丰富，素有华北天然动植物园之称，有四个植被类型，十个森林群落。保护区还以“天然动物园”而闻名。野生动物主要有狍子、野猪、狐狸、刺猬、野山羊、狼、獾以及稀有动物红蝮蛇等。还有多达三百余种的鸟类，每当春秋两季候鸟迁徙时，这里就成为各种鸟类聚集的地方。
百花山的景观特点是其保护完好的原始风光，因此这里是自然探索的绝佳去处。百花山环境独特，风景优美，是一个很好的旅游场所。年降水量在720㎜以上，年均气温6-7℃，七月份平均温度22℃，负氧离子含量为5级，是消夏避暑的胜地。
北京百花山自然保护区已知陆栖野生脊椎动物20目47科169种，其中，兽类6目13科25种，鸟类11目27科131种，爬行类2目3科7种，两栖类1目4科6种。另外，已查明的昆虫种类10目73科1000余种。国家级重点保护的野生动物有褐马鸡、金雕、金钱豹等14种。
北京百花山自然保护区的兽类，以啮齿目动物占优势，占整个兽类种数的40%；食肉目次之，占24%；其次是食虫目，占16%；翼手目和偶蹄目都占8%；兔形目最少，占4%。保护区的鸟类共11目，雀形目占绝对优势，占保护区整个鸟类的80%；隼形目占4.62%；鴷形目3.07%；鸡形目、鹃形目、鴞形目均占2.31%；鸽形目、雨燕目均占1.54%；鹳形目、夜鹰目、佛法僧目均占0.77%。两栖爬行类中，无尾目6种，占保护区整个两栖爬行类的46.15%；蛇目5种，占38.46%；蜥蜴目2种，占15.39%。
百花山自然保护区高等植物共计131科，485属，1100种（包括亚种、变种、变型等）。其中，苔藓植物17科、25属、30种，蕨类植物13科、21属、38种，裸子植物4科、7属、19种，被子植物97科、432属、1013种，分别占北京市植物总科数的69%、总属数的51%、总种数的49%。特有种类有百花山花楸、百花山柴胡、百花山葡萄、百花山毛苔草、百花山鹅观草等5种；国家重点保护植物有紫椴和黄檗等2种。
1、苹果园地铁站西边乘892路公交车到达百花山（黄塔张家铺方向）。每天早9：00和下午4：30共两趟。
2、房山长途汽车站可乘房20路，房25路到龙门台村，车程2小时。车次不多，末班15:45。
1、京石高速路至房山出口——坨里——108国道——贾峪口路口右转弯去史家营方向即到。
2、走109国道是从门头沟方向进入景区，到达的地点就是张家铺。
3、走108国道至贾峪口不右转，一直到龙门台村，再往北到四马台村，沿着路一直开就能到四马台村的景区入口。这边叫白草畔，也叫房山世界地质公园，到景区门口后坐景区观光，走15公里左右到达山顶的五指峰，然后有通往大草甸的木栈道，走1小时左右到大草甸，是能上到草甸最轻松的方式。
北京百花山国家级自然保护区地处北京西部，位于北京市门头沟区清水镇境内，地理坐标为东经115°25′—115°42′，北纬39°48′—40°05′，占地总面积为21743.1公顷。
北京百花山国家级自然保护区地貌主要受大地构造控制，中北部及西南部属于北京北山隆起构造区，地貌类型为山地侵蚀构造地貌，约占北京百花山国家级自然保护区面积的90%，地势陡峻，河流下切深。东南部属于北京西山凹陷构造区的西山褶皱隆起区，地貌类型为侵蚀构造地貌或堆积地貌，仅占北京百花山国家级自然保护区面积的10%左右，地势较平缓，并发育宽浅河谷。
北京百花山国家级自然保护区地处亚高山地带，属于中纬度温带大陆性季风气候区，垂直变化明显，昼夜温差大，气温偏低，降水量较多，四季分明，冬季寒冷多风且干燥，夏季温热多雨，春季干旱，风沙盛行，秋季晴朗少风，寒暖适中，但雨量偏少。
北京百花山国家级自然保护区在地质构造上位于华北陆台中部的燕山沉降带，其中北部属于北京北山隆起构造区的青白穹窿区，南部属于北京西山凹陷构造区的西山褶皱隆起区。北京百花山国家级自然保护区的地层主要有元古界震旦系、古生界寒武系、奥陶系、石炭系，以及中生界侏罗系和新生界第四系等，岩石种类比较齐全，包括多种沉积岩、变质岩和火成岩。
北京百花山国家级自然保护区在中国土壤区划中属于褐色土地带，共有4个土类，9个亚类，分比为（1）草甸土：亚高山草甸土。（2）棕壤：山地棕壤；山地生草棕壤；山地粗骨棕壤。（3）褐土：淋溶褐土；普通褐土；粗骨褐土；碳酸盐褐土。（4）耕作土：耕作土。
1985年，北京市人民政府批建成立了“北京百花山自然保护区”，归北京市门头沟区人民政府领导，为省市级自然保护区。
2008年1月，国务院批准百花山保护区晋升为国家级自然保护区。
2015年，北京百花山国家级自然保护区与美国谢南多厄国家公园签署姊妹园区合作协议。
