北京师范大学南山附属学校是由北京师范大学和深圳市南山区人民政府按照“国有联办、委托管理、自主办学”的模式，于2000年合作创办的一所十二年一贯制的现代化公立学校，是北京师范大学在京外举办的附属学校。北师大和南山区对学校的发展非常重视，拟成立学校管委会推动学校更快、更好发展，由北师大主管附校工作的副校长和南山区主管教育的副区长担任管委会的主任。
学校坐落在深圳市南山区美丽的深圳湾畔，拥有中学部、小学部两个相对独立的校园。学校占地面积67000平方米，绿化覆盖率约60%，校园建筑面积约56000平方米，现代化的教学设备，时尚的多功能厅室、运动场馆，配套齐全的生活设施，为师生在校的工作、学习和生活提供了完善舒适的保障。
据官网2019年12月22日显示，学校共有100个教学班（其中，小学部47个班，中学部有53个教学班），在校学生4600余名，教职工350余名。专任教师中，现有特级教师3人，高级职称教师80余名，学历达标率高。
学校依托北师大雄厚的教育资源，在市、区两级地方政府的关怀下，践行“个性化的全面发展”的办学理念，努力探索新时期中小学教育发展的新模式，切实推进优质教育、品牌教育、服务教育，为高一级学校输送了大量的合格加特长的人才，取得了令人瞩目的办学成就。建校以来，学校获得了“广东省一级学校”、“广东省绿色学校”、“广东省现代教育技术实验学校”、“全国中小学思想道德建设活动先进单位”、“深圳市先进单位”、“深圳市现代制度建设先进学校”、“南山区教育现代化示范学校”等50多项荣誉。被广东省教育厅评估组专家誉为是“一所让政府放心、家长认可、学生热爱、教师向往、同行尊重的现代化学校。”
学校挂牌成为：中国教科院骨干校长和骨干基地、北京师范大学基础教育合作办学平台中学生物教育研究共同体秘书处、深圳市现代学校制度建设先进学校、深圳市中小学综合素养培养试点学校、市民走进身边的好学校、华南师范大学中小学教师培训实践基地、南山区教师发展基地、南山区少年创新院、深圳市南山区中小学课程建设基地、中国创新教育联盟、中国FabLab校际联盟、西安交通大学少年班生源基地、东南大学少年班生源基地、广东省体育传统项目学校……累计获得四十余项荣誉称号及挂牌。
现任校长
田军，男，1978年3月生，中共党员，硕士研究生学历（在职），中学化学高级教师。历任北京市东直门中学教学处主任，北京市东城区教委中教科教学视导员，北京四中教学处副主任，北京市西城区教委中教科科长。曾在北师大二附中党委副书记、副校长岗位上挂职。2019年9月起任北京师范大学南山附属学校校长。
田军校长将秉持“用心做符合规律的好教育”的教育追求，带领北师大南山附校在二十年奋斗的基础上，践行“个性化的全面发展”办学理念，继续扛起历史使命，抓住发展机遇，开创学校优质发展的新时代。
第一任校长
陈俊辉，男，特级教师，现任深圳北京师范大学南山附属学校校长，从事中学数学教学研究及教育管理近40年，是全国数学教育专家和中小学奥林匹克教育专家，长期担任中国教育学会中学数学教学专业委员会常务理事和北京数学教学研究会副理事长。
2000年5月，陈校长受北师大领导的重托，奉命担任北师大南山附校校长、法人代表。五年以来，学校在教师队伍建设、课程改革、校园文化建设、教育信息化、办学特色等方面做了大量卓有成效的工作，取得了令人瞩目的成绩，实现了学校的高起点办学、高标准发展，得到了相关领导和社会各界的高度肯定和赞誉。2004年，陈校长主编了《走进新课程的探索与实践》（世界图书出版公司出版），其个人专著《创建特区品牌学校的理论与实践》也于2005年9月由北京师范大学出版社正式出版。
第二任校长
杜中臣，男，1963年出生，籍贯山东招远，中共党员，先后获得北京师范大学哲学学士、逻辑学硕士，法学博士等学位，2006年进入北京师范大学教育管理学院博士后流动站工作。北京师范大学哲学和社会学学院副教授。2007年3月份出任深圳北京师范大学南山附属学校书记、校长。
杜中臣校长有丰富的教育教学经验和管理经验，在北京师范大学哲学和社会学院，他曾连续担任了13届班主任，并历任级主任和系副主任。在高校教学中，他一直担纲主讲19届本科和硕士研究生课程，连续指导了5届逻辑学和思想政治教育研究生。获得了很好的学生评价和学校反响。
第三任校长
彭雪花，女，1964年出生。1986年毕业于哈尔滨师范大学物理系，理学学士学位。2000年毕业于东北师范大学物理学研究班201被授予特级教师称号；北京市物理特级教师；黑龙江省骨干教师；哈尔滨师范大学理化学院硕士研究生导师、首都师范大学教育学硕士导师；中国高等教育学会“西部教育顾问”。曾获评哈尔滨市“二十名师”、哈尔滨市优秀党员、哈尔滨市信息技术教育先进个人；哈尔滨市思想道德建设先进个人等荣誉。历任黑龙江省级重点中学哈尔滨第六中学物理教师、教学副校长、北京市丰台二中副校长等职。2011年7月起任北京师范大学南山附属学校校长。
彭雪花校长长期工作在教育一线，对物理学科教学有着独到的见解和研究的方法，有着丰富的教学经验和成熟的学科教学思想，多篇科研论文获国家及省市级奖励。在学校管理工作中，彭校长敢创新，思路清，效率高。就职北师大南山附校以来，彭雪花校长提出“外塑形象、内铸品质”的发展理念，着力提升学校核心竞争力，全面加快学校改革与发展的步伐，带领学校进入了一个可持续发展的崭新的历史阶段。
